После разрушения лаборатории двум мышам-исследователям приходится искать новое пристанище у девочки по имени Элмайра, которая приобрела их в зоомагазине. Теперь Брейн сталкивается с новыми трудностями в своих планах по завоеванию мира: у него под рукой оказывается жестокая девочка, глуповатый помощник Пинки и недостаток необходимых научных инструментов.

Ситуация осложняется тем, что Элмайра, известная своей любовью к экспериментам над животными, не оставляет мышам шансов на спокойную жизнь. Брейну предстоит придумать, как справиться с этой неординарной ситуацией и найти выход из затруднительного положения, чтобы продолжить свои амбициозные замыслы.