Четверо черепашек-ниндзя, всю жизнь проведшие в укрытии от людей в нью-йоркских канализациях, решают выйти на поверхность и начать жизнь, похожую на жизнь обычных подростков. В этом им помогает новая знакомая Эйприл О’Нил, с которой они объединяются для борьбы с известным преступным синдикатом и его армией мутантов.

Находясь на поверхности, братья сталкиваются с множеством испытаний, но их навыки ниндзюцу и дружба с Эйприл помогают преодолевать трудности. Вместе они стремятся остановить злодеев и защитить свой новый дом, открывая для себя мир, полный приключений и опасностей.